水环式真空泵也有其缺点：
效率低，一般在30%左右，较好的可达50%。
真空度低，环保真空泵，这不仅是因为受到结构上的限制，更重要的是受工作液饱和蒸气压的限制。用水作工作液，极限压强只能达到2000~4000Pa。用油作工作液，可达130Pa。
由于水环式真空泵中气体压缩是等温的，干式罗茨真空泵，故可以抽除易i燃、易i爆的气体。由于没有排气阀及摩擦表面，故可以抽除带尘埃的气体、可凝性气体和气水混合物。有了这些突出的特点，它效率低，仍然得到了广泛的应用。
水环式真空泵正常工作以后需要注意的有两点：
尽可能要求所选真空泵的真空度要求在高效区间内，水环罗茨真空泵机组，也就是在临界所需真空度或临界所需排气压力的区域内运行，这样才能保证真空泵能够按照需要的条件和要求正常工作。应避免在真空泵Zuii大真空度或Zuii大排气压力范围附近运行。在这个区域内运行，不仅效率极低，工作很不稳定，容易使真空泵产生振动和噪音。对于真空度较高的真空泵而言，在此区域之内运行，往往还会发生汽蚀现象，产生这种现象的明显现象是真空泵内有噪音和振动。过大的汽蚀会导致泵体、叶轮等零部件的损坏，安徽真空泵，以致于真空泵无法正常工作。
由此可以看出，当真空泵所需的真空度或气体压力不高时，可以优先在单级泵中选取。如果对真空度或排气压力要求较高，单级泵往往不能满足，或者，要求泵在较高真空度情况下仍有较大气量，即要求性能曲线在较高真空度时较平坦，可选用两级泵。如果真空度要求在－710mmHg以上，可选用罗茨水环真空机组作为抽真空装置。
由于煤炭产量的飞速增加，煤矿的洗、选煤所用的真空过滤机也向大型化方面发展，在八十年代大多配抽气量为27m3／min的SZ-4型水环真空泵，这在当时也是较大的。而近几年煤矿的过滤机都选配抽气量为80--150m3／min的大型水环真空泵，有的达到200m3／min以上，还有气量继续增大的趋势。
轻工行业的食品、啤酒企业以及冶金、石化、电i石、建材等行业的真空系统均向大型方面发展，如山东某铝厂长期使用多台抽气量为85m3／min的水环真空泵，而去年的技改项目设备招标要求的水环真空泵抽气量要达到140m3／min。
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