高新技术企业认定中，对企业知识产权情况采用分类评价方式，其中：发明专利（含专利）、植物新品种、农作物品种、国家新药、国家一级中药保护品种、集成电路布图设计专有权等按Ⅰ类评价在同一高新技术企业资格有效期内，企业累计两年未按规定时限报送年度发展情况报表的，由认定机构取消其高新技术企业资格，在国家“高新技术企业认定工作网”上公告。
研发项目既要结合企业实际体现行业的先进性，合肥高企认定，在技术材料的编制过程中也要注意与领域的契合。申请认定时专利的有效性以企业申请认定前获得授权证书或授权通知书并能提供缴费收据为准。研发项目要符合《高新技术企业认定管理工作指引》对企业研究开发活动的定义，高企认定办理，具备一定的创新性和创造性(项目鉴定、科技计划政府立项、产学研合作、相关知识产权申请等)。
企业创新能力评价应达到相应要求；
企业创新能力主要从知识产权、科技成果转化能力、研究开发组织管理水平、企业成长性等四项指标进行评价。各级指标均按整数打分，满分为100分，综合得分达到70分以上（不含70分）为符合认定要求
企业应正确归集研发费用，由具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构进行专项审计或鉴证。
企业的研究开发费用是以单个研发活动为基本单位分别进行测度并加总计算的。企业应对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写《高新技术企业认定申请书》中的“企业年度研究开发费用结构明细表”。
企业应按照“企业年度研究开发费用结构明细表”设置高新技术企业认定专用研究开发费用辅助核算账目，提供相关凭证及明细表，并按本《工作指引》要求进行核算。.
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